Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm5407E9Q7Q1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm5407E9Q7Q1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm5407E9Q7Q1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5407E9Q7Q1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5407E9Q7Q1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5407E9Q7Q1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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