Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
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