Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r238E9Q373 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms