Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms