Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms