Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5415E9PXF3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms