Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20521D3Z5F7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20521D3Z5F7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms