Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif28pD3YXS5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kif28pD3YXS5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms