Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn24D3YXJ9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms