Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pnldc1B2RXZ1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms