Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfc3h1B2RT41 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfc3h1B2RT41 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms