Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zbed5B2RPU8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zbed5B2RPU8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms