Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ssxb8B1AY40 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ssxb8B1AY40 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ssxb8B1AY40 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ssxb8B1AY40 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ssxb8B1AY40 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ssxb8B1AY40 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ssxb8B1AY40 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb8B1AY40 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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