Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik3B1AS29 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms