Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6880A3KG45 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6880A3KG45 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms