Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn3aA2ASI5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms