Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb1A2AQ07 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubb1A2AQ07 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms