Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap5A2AGT5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ckap5A2AGT5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ckap5A2AGT5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms