Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frmpd4A2AFR3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms