Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700023F06RikA2AB62 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700023F06RikA2AB62 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms