Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms