Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms