Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv5A0A0B4J1G9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv5A0A0B4J1G9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv5A0A0B4J1G9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trbv5A0A0B4J1G9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trbv5A0A0B4J1G9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv5A0A0B4J1G9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv5A0A0B4J1G9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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