Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trbv23A0A0A6YWQ1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trbv23A0A0A6YWQ1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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