Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms