Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GDE1Q9NZC3 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GDE1Q9NZC3 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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