Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.47
LAMA3Q16787 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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LAMA3Q16787 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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LAMA3Q16787 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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LAMA3Q16787 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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LAMA3Q16787 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
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LAMA3Q16787 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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LAMA3Q16787 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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LAMA3Q16787 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
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LAMA3Q16787 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
LAMA3Q16787 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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