Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ZNF239Q16600 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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