Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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SGCAQ16586 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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