Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMAD1Q15797 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms