Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KARSQ15046 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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KARSQ15046 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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KARSQ15046 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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KARSQ15046 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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KARSQ15046 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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KARSQ15046 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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KARSQ15046 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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