Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC3Q15034 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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