Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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SHPRHQ149N8 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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