Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SMC1AQ14683 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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