Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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LSAMPQ13449 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LSAMPQ13449 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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