Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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SP140Q13342 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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SP140Q13342 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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SP140Q13342 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SP140Q13342 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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SP140Q13342 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SP140Q13342 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SP140Q13342 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SP140Q13342 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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SP140Q13342 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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SP140Q13342 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SP140Q13342 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
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SP140Q13342 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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