Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATMQ13315 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATMQ13315 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATMQ13315 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATMQ13315 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATMQ13315 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATMQ13315 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATMQ13315 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATMQ13315 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATMQ13315 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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