Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHAF1AQ13111 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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