Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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TRAF1Q13077 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF1Q13077 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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