Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HSPB3Q12988 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HSPB3Q12988 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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