Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF2Q12933 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRAF2Q12933 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms