Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
LMAN2Q12907 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LMAN2Q12907 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LMAN2Q12907 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LMAN2Q12907 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LMAN2Q12907 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LMAN2Q12907 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LMAN2Q12907 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LMAN2Q12907 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LMAN2Q12907 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LMAN2Q12907 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LMAN2Q12907 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.1 ms