Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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CNTN1Q12860 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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CNTN1Q12860 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNTN1Q12860 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNTN1Q12860 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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