Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
FOXO1Q12778 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms