Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRTM2O43300 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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