Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
J3KRW8 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
J3KRW8 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
J3KRW8 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
J3KRW8 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
J3KRW8 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
J3KRW8 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
J3KRW8 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
J3KRW8 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
J3KRW8 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
J3KRW8 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
J3KRW8 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
J3KRW8 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
J3KRW8 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
J3KRW8 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
J3KRW8 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
J3KRW8 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms