Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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