Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD2Q9BSE4 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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