Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNAPC1Q16533 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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SNAPC1Q16533 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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