Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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